商业用房的房产税由房产所在地的税务机关依照房产原值一次减除10%至30%后的余值按年征收。商业用房的房产税征收时从价计征的税率为1.2％，从租计征的税率为12％。

法律依据

《房产税暂行条例》第三条

房产税依照房产原值一次减除10%至30%后的余值计算缴纳。具体减除幅度，由省、自治区、直辖市人民政府规定。没有房产原值作为依据的，由房产所在地税务机关参考同类房产核定。房产出租的，以房产租金收入为房产税的计税依据。

第四条

房产税的税率，依照房产余值计算缴纳的，税率为1.2%；依照房产租金收入计算缴纳的，税率为12%。

第七条

房产税按年征收、分期缴纳。纳税期限由省、自治区、直辖市人民政府规定。

第九条

房产税由房产所在地的税务机关征收。

根据《财政部、国家税务总局关于具备房屋功能的地下建筑征收房产税的通知》（财税〔2005〕181号）规定，凡在房产税征收范围内的具备房屋功能的地下建筑，包括与地上房屋相连的地下建筑以及完全建在地面以下的建筑、地下人防设施等，均应当依照有关规定征收房产税。上述具备房屋功能的地下建筑是指有屋面和维护结构，能够遮风避雨，可供人们在其中生产、经营、工作、学习、娱乐、居住或储藏物资的场所。出租的地下建筑，按照出租地上房屋建筑的有关规定计算征收房产税。自用的地下建筑，按以下方式计税：

1.工业用途房产，以房屋原价的50%～60%作为应税房产原值。应纳房产税的税额=应税房产原值×〔1－(10%－30%〕×1.2%。

2.商业和其他用途房产，以房屋原价的70%～80%作为应税房产原值。应纳房产税的税额=应税房产原值×〔1－(10%－30%)〕×1.2%。房屋原价折算为应税房产原值的具体比例，由各省、自治区、直辖市和计划单列市财政和地方税务部门在上述幅度内自行确定。

3.对于与地上房屋相连的地下建筑，如房屋的地下室、地下停车场、商场的地下部分等，应将地下部分与地上房屋视为一个整体按照地上房屋建筑的有关规定计算征收房产税。

上述规定自2006年1月1日起执行，《财政部税务总局关于房产税、车船使用税若干具体问题的解释和暂行规定》第十一条，为鼓励利用地下人防设施，暂不征收房产税的规定废止。但个人所有的地下建筑用于居住的，根据《房产税暂行条例》第五条，个人所有非营业用房产免征房产税的规定，对此类地下建筑免征房产税。