分别是关系不同、费用不同等区别。

1、关系不同，当公司委托代理公司缴纳社保的时候，代理公司和公司之间是一个委托关系，需要签订委托协议，不存在真实劳动关系；企业缴纳社保是与员工直接缴纳，员工和公司存在真实的劳动关系；

2、费用不同，如果个人选择通过代理公司来缴纳社保，个人需要承担个人缴纳部分和公司应缴纳部分，还会附加一个服务费；公司给员工直接缴纳社保的话，员工只需要承担个人缴纳部分即可。

社保缴纳所需材料如下：

1、个人交社保，个人交社保只能参加养老保险和医疗保险，需带上个人有效身份证件、失业证和2张1寸照片，到当地社保中心办理即可；

2、企业给员工交社保，提供企业的营业执照正本原件和复印件，组织机构代码证正本原件和复印件，参保员工身份证复印件，参保人员工资单，公章。

希望以上内容能对您有所帮助，如果您还有其它问题请咨询专业律师。

法律依据：《中华人民共和国社会保险法》第二十三条

职工应当参加职工基本医疗保险，由用人单位和职工按照国家规定共同缴纳基本医疗保险费。

无雇工的个体工商户、未在用人单位参加职工基本医疗保险的非全日制从业人员以及其他灵活就业人员可以参加职工基本医疗保险，由个人按照国家规定缴纳基本医疗保险费。

第七条

国务院社会保险行政部门负责全国的社会保险管理工作，国务院其他有关部门在各自的职责范围内负责有关的社会保险工作。

县级以上地方人民政府社会保险行政部门负责本行政区域的社会保险管理工作，县级以上地方人民政府其他有关部门在各自的职责范围内负责有关的社会保险工作。